蛋白质的三维结构决定其功能，精准预测曾是科学难题，AlphaFold 通过整合进化信息与深度学习实现突破，但仍难以处理动态复合物和无同源序列的目标。相比之下，RNA 结构预测面临更大数据稀缺与结构不稳定的挑战，当前研究仍处于早期阶段。尽管如此，靶向 RNA 的小分子药物已取得里程碑进展，如利司扑兰通过调控 RNA 治疗脊髓性肌萎缩症。目前 AI 在药物研发中更多扮演加速器角色，尤其在构建预测模型与筛选分子库方面提升效率，但受限于数据质量与化学可合成性，尚未实现根本性革命。未来方向在于融合物理规律与 AI，建立对分子世界的底层理解，推动真正意义上的原创新药发现。